阿奇霉素与克拉霉素都是属于大环内酯类抗菌物，它们通过作用于细菌的核糖体，有效地抑制细菌蛋白质的合成，属于典型的抑菌剂。尽管它们的抗菌谱相对较窄，但在临，它们主要用于治疗以下几种类型的感染。
对于呼吸道感染，大环内酯类抗菌物对引发呼吸道感染的常见病原体，如肺炎链球菌、溶血性链球菌、嗜血杆菌以及卡他莫拉菌等，都具有良好的抗菌效果。在治疗细菌性扁桃体炎、咽炎时，对于青霉素或头孢菌素过敏的患者，这两种物可以作为替代选择。值得注意的是，克拉霉素对于呼吸道感染中常见的阳性球菌，如肺炎链球菌和溶血性链球菌，其抗菌活性更为突出，且耐性产生较慢。在治疗咽炎、扁桃体炎以及耳鼻喉部位细菌感染时，其疗效优于阿奇霉素。而在社区获得性肺炎的常见病原体中，阿奇霉素对肺炎支原体的抗菌活性要强于克拉霉素，在应对肺炎支原体感染时，阿奇霉素通常是首选物。尽管近年来肺炎支原体对大环内酯类的耐现象逐渐增多，使得这类物不再是治疗支原体感染的首选，但在特定情况下，例如对于儿童患者，由于喹诺酮类物不适用于18岁以下的未成年人，因此阿奇霉素等大环内酯类物依然是治疗肺炎支原体感染的首选方案。
对于消化系统感染，克拉霉素与多种抗菌物如阿莫西林、四环素、甲硝唑、左氧氟沙星以及呋喃唑酮等，都被相关指南推荐用于根除幽门螺杆菌。阿奇霉素并不适用于治疗幽门螺杆菌感染。阿奇霉素是急性细菌染性腹泻的唯一推荐物，特别是对于那些无法使用喹诺酮类物的儿童患者。而克拉霉素则不在推荐名单之内。
对于泌尿道感染，治疗时应优先选择对革兰阴性菌具有较高抗菌活性的头孢菌素类物或左氧氟沙星等喹诺酮类物。但对于由沙眼衣原体引起的特异性炎、宫颈炎等，阿奇霉素则是首选的治疗物。
除了在抗菌适应症上存在差异外，阿奇霉素和克拉霉素在不良反应和用法用量方面也有所不同。这两种物都是时间依赖性抗菌物，其治疗效果取决于物与致病菌接触的时间。提倡将一日总剂量分次给予。在感染性疾病的治疗过程中，阿奇霉素由于其超长约70小时的半衰期，抗菌作用持续时间较长，通常情况下可以一天一次给。而克拉霉素则需要一天两次给。