羟基和氢氧根虽然都含有氢、氧元素，且结构上相似，但在化学性质和定义上有明显的区别。首先，羟基（-OH）是一个中性基团，通常存在于有机化合物中，如醇类。羟基中的氧原子与碳原子通过共价键连接，而氢原子则通过氧原子连接。羟基是官能团，参与多种有机反应，如氧化、还原和脱水等。
相比之下，氢氧根（OH-）是一个带负电荷的离子，是水溶液中常见的碱性离子。氢氧根中的氧原子和氢原子通过极性共价键连接，整体带一个负电荷。氢氧根在水中可以电离出氢氧根离子，使溶液呈碱性，参与酸碱中和反应、沉淀反应等。
此外，羟基和氢氧根在存在形式上也有所不同。羟基通常作为有机分子的组成部分存在，而氢氧根则主要存在于水溶液中，特别是在碱性溶液中。因此，羟基和氢氧根在化学性质、存在形式和反应中的作用都有显著差异。