自然界的微生物因种类多样，对营养的需求也各有不同。在菌种分离、保藏以及工业发酵过程中，需要根据每种微生物的特性来配制相应的培养基。
在科研生产上，培养基的配制主要按照所用原料的不同，分为天然培养基和合成培养基或综合培养基两类。天然培养基主要应用肉汤、马铃薯汁等天然成分，而合成培养基则是由化学品配制并标明成分。由于液体培养基不便长期保存，现在已有公司将其改制成粉末。对于需要严格灭菌的培养基，如一些特殊微生物的培养基，长时间的储存必须放在2~6℃的冰箱内。
以下是常见微生物的培养基配方：
一、细菌培养基
配方一：牛肉膏琼脂培养基，用于培养细菌。
配方二：肉汤培养基，主要用于培养一些需要肉类营养的细菌。
配方三：根瘤菌培养基，适用于培养根瘤菌。
配方四：LB培养基，一种广泛使用的原核表达菌种的培养基。
二、放线菌培养基
配方一：淀粉琼脂培养基（高氏培养基），适用于培养放线菌。
配方二：面粉琼脂培养基，也是培养放线菌的常用培养基。
三、真菌培养基
配方一：萨氏（Sabouraud’s）培养基，可培养许多种类真菌。
配方二：马铃薯糖琼脂培养基，用于培养霉菌和酵母菌。
配方三：豆芽汁培养基，用于培养细菌和放线菌。
四、酵母培养基
包括基础培养基、基本培养基和YNB培养基等，各有不同的配方和使用方法。
五、食用菌菌种培养基
配方一：马铃薯-蔗糖-琼脂培养基。
配方二：综合马铃薯培养基，用于培养和保存灵芝、平菇、香菇等食用菌菌种。
六、蓝藻培养基
蓝藻培养常使用BG-11培养基，这是一种专门为蓝藻设计和优化的培养基。灰藻生物提供各类微生物的生物资源，包括ATCC原装菌株和ScienCell原代细胞代理等，致力于为客户提供专业、稳定、优质的生物资源。灰藻生物的使命是成为“生命科学研究的好伙伴”。
