宙斯对普罗米修斯怀恨在心，根源在于普罗米修斯对宙斯权威的挑战以及他对人类福祉的深切关怀，这两者形成了尖锐的冲突。首先，普罗米修斯作为一位智慧之神，预见到宙斯即将取代其父克洛诺斯成为众神之王。宙斯在发动“奥林匹斯之战”推翻克洛诺斯统治时，普罗米修斯曾试图劝阻，提醒宙斯反抗父辈可能导致混乱和内战，但宙斯决心已定，并未听从。这为两人埋下了不和的种子。
更为关键的是，普罗米修斯在宙斯成为众神之王后，并未对新的统治者表示绝对顺从。他同情受宙斯严酷统治压迫的人类，暗中帮助他们，并为他们盗取了火种，赋予了人类文明的可能性。这直接触犯了宙斯的权威，因为火代表着知识和力量，人类获得火后，便不再完全依赖众神。宙斯视此为对自身统治的极大威胁。
因此，宙斯对普罗米修斯的仇恨，不仅源于预言未准的怨恨，更深层次的是对普罗米修斯挑战其权威、帮助人类获得独立能力的愤怒。为了惩罚普罗米修斯，宙斯施以残酷的惩罚：将普罗米修斯锁在高加索山的悬崖上，让恶鹰不断啄食他的肝脏，而肝脏又能再生，永无宁日。这一惊天秘密揭示了宙斯维护统治不惜一切代价的冷酷本质，也展现了普罗米修斯不畏强权、牺牲自我的伟大精神。