教资认定不通过的原因包括以下几种情况：
对于一年内多次申请认定的情况，教师资格证认定规定同一申请人在同一年内只能申请认定一种教师资格证。如果超出这个次数限制，认定将不会通过。需要特别注意申请的次数和时间段。
户籍或居住证问题。与教资考试类似，教资认定的申报地区也有一定限制。对于普通高校在校生，可以在学校所在地和户籍所在地申请教资认定；社会考生则可以在户籍所在地和居住证所在地申请。如果需要在工作所在地申请认定，必须提前办理居住证，办理时间通常需要7至15个工作日。
对于在校生的年级也有要求。大部分地区限制应届高校毕业生只能在最后一个学期参加教资认定。研究生在读期间通常需要在学校所在地进行认定，同时也可以使用本科学历在户籍地认定。具体的要求需以当地的认定公告为准。
普通话等级也是影响教资认定的一个重要因素。不同省市对普通话等级的要求有所不同，部分省市要求所有学科达到二乙水平即可，而个别省市对播音主持、影视剧、表演等专业教师则要求一乙以上水平。对于母语非汉语的申请人员，通常要求达到三甲水平。值得注意的是，普通话是教资认定的必备材料，而普通话考试后通常需要等待30个工作日才能领取，因此需提前安排好普通话考试的时间，确保在认定前取得。（具体以当地认定公告为准）
体检结果不合格也是教资认定不通过的原因之一。虽然大部分考生都能顺利通过体检环节，但以下问题可能导致不予通过：患有癫痫病、夜游症、恶性、严重血液病、精神病等病史；患有肺结核、支气管扩张、慢性肾炎、甲肝等疾病且未治愈；身高不符合要求（男性低于155cm，女性低于150cm）；患有严重心、各种结缔疾病、类风湿脊柱疾病等。（各地教资体检要求不同，具体以当地公告为准）。
