益母草和艾草虽然名字里都有“草”字，外观也有一定的相似性，容易让人混淆，但它们在植物学分类、性味归经、功效主治以及日常用法上都有明显的区别，需要仔细辨别。
首先，从植物学角度看，益母草（Leonurus japonicus）是唇形科益母草属的草本植物，而艾草（Artemisia argyi）是菊科蒿属的植物。两者科属不同，形态上也有差异：益母草茎方柱形，上部有分枝，叶对生，花小，唇形；艾草茎直立，不分枝或上部有分枝，叶互生，羽状分裂，花黄色，头状花序。
其次，在中医理论中，它们的性味归经和功效也不同。益母草味辛、苦，性微寒，归心、肝、膀胱经，主要功效是活血调经、利尿消肿，常用于治疗月经不调、痛经、闭经、产后瘀阻腹痛以及水肿小便不利等。而艾草味苦、辛，性温，归肝、脾、肾经，主要功效是温经止血、散寒止痛、祛湿止痒，常用于治疗虚寒性出血、经寒腹痛、皮肤瘙痒以及外用祛湿止痒、杀虫。可以看出，益母草偏重于活血化瘀调经，而艾草则偏重于温经止血散寒。
最后，在日常应用中，两者用途也大不相同。益母草通常制成中药制剂内服，如益母丸、益母片等。而艾草的用途更为广泛，除了制作成艾条、艾绒用于艾灸外，还可以晒干用作针灸的“艾绒”，或者煮水外洗用于治疗湿疹、皮肤病，还可以食用，如艾叶煎鸡蛋、艾叶粥等。
因此，益母草和艾草虽然名字相似，但它们是两种不同的植物，具有不同的药用价值和用途，使用时必须明确区分，切不可混淆。