自制羊奶想要彻底杀菌，最有效且常用的方法是高温灭菌处理。这通常指的是巴氏杀菌法或更彻底的高温短时灭菌法（如UHT灭菌）。巴氏杀菌法分为两种：一种是在62-65℃下保持30分钟，另一种是在72-75℃下保持15-16分钟。这种方法能杀死大部分致病菌和腐败菌，同时相对保留羊奶的部分营养成分和风味，适合制作需要冷藏保存的羊奶制品。
而UHT灭菌则是在135-150℃的高温下保持几秒钟到十几秒钟，这种方法能更彻底地杀死所有微生物，包括芽孢，使得羊奶可以在常温下保存数个月。但UHT灭菌的温度较高，可能会对羊奶的营养成分和风味造成更大的影响。
无论是采用巴氏杀菌法还是UHT灭菌，都需要使用专业的杀菌设备，如杀菌锅、巴氏杀菌机或UHT灭菌机等。在操作过程中，需要严格控制温度、时间和压力等参数，以确保杀菌效果。此外，杀菌后的羊奶还需要迅速冷却，以防止微生物的再次滋生。
需要注意的是，即使经过彻底的杀菌处理，羊奶制品在储存和运输过程中仍需保持清洁卫生，避免微生物的二次污染。同时，自制的羊奶制品由于缺乏商业产品的严格监控和质量控制，存在一定的食品安全风险，建议谨慎制作和食用。