自来也之所以败给佩恩，实力差距确实非常大，但这并非唯一原因。首先，佩恩作为“六道”之一，其实力早已超越了普通的晓组织干部。他不仅拥有六种强大的查克拉形态，还能分身控制，甚至具备直接攻击他人灵魂的“神罗天征”等能力，这些能力在层次上就远超自来也。
然而，自来也并非没有机会。在战斗中，他展现了高超的忍术技巧和丰富的战斗经验，甚至一度压制了佩恩的部分分身。但是，佩恩的攻击方式更加诡异和致命，尤其是对自来也灵魂的攻击，让他在无法使用最强忍术的情况下陷入了被动。
此外，自来也为了救治卡卡西而耗尽了大量的查克拉，这也是他最终落败的一个因素。如果状态完全，自来也或许能够与佩恩抗衡，但现实情况却是他力不从心。因此，虽然自来也展现了不屈的意志和强大的实力，但面对佩恩这样层次完全不同的对手，他最终还是败了。这场战斗不仅展现了佩恩的强大，也让我们看到了自来也的伟大。