MT 提供了以 root 身份操作文件的功能，但这并不意味着使用 MT 必须具备 root 权限。只有当您需要进行访问 /data 目录、挂载 /system 读写等敏感操作时，才需要 root 权限。
在主设置界面中，与 root 权限相关的选项有获取 root 权限和自定义 su 命令。
启用获取 root 权限选项后，MT 会在启动过程中尝试获取 root 权限。如果您的设备没有 root 权限或者您拒绝授予 MT root 权限，关闭该设置可以显著提升启动速度。需要注意的是，更改此设置后需要重新启动 MT 才能生效。
自定义 su 命令功能允许您配置在获取 root 权限时调用的命令，通常情况下该命令为 su，但您也可以根据需要自行设置其他命令。
为了验证 MT 是否已成功获取 root 权限，您可以通过以下方法进行判断：
尝试访问 /data 目录，如果目录中存在内容，则说明已获得 root 权限。尝试挂载根目录或 /system 为可读写状态，如果挂载操作成功，则证明已获得 root 权限。如果在上述方法中，第一个操作成功但第二个操作失败，那么可能是您的设备制造商对 root 权限进行了限制，即 root 权限不完整。针对这种情况，具体的解决方法需要根据您的设备型号自行查找相关资料。
挂载操作的具体步骤如下：首先进入目标挂载目录，然后点击 MT 右上角的菜单按钮，从弹出的选项中选择挂载读写/只读。
由于 API 的限制，MT 在处理压缩文件（包括打开压缩文件、解压、添加文件等操作）的内部流程无法通过 root 权限路径进行，因此无论您是否具备 root 权限，在操作压缩文件时都不会受到影响。
解压文件时，建议不要直接解压到系统目录，而是先解压到内部存储中，以避免权限问题。如果确实需要将文件复制到系统目录，可以先解压到内部存储，然后再将文件从内部存储复制到目标位置。避免在系统目录中直接操作压缩文件，否则也容易遇到权限不足的问题。许多新手用户习惯直接在 /data/app 目录中操作 apk 文件，这是一个非常不推荐的做法。正确的操作方式是先将 apk 文件复制到内部存储，进行修改后再进行签名安装。