在初中三年的学习过程中，科目二和科目三的成绩差距通常在初二开始显现。科目二主要指的是基础学科，如语文、数学和英语，这些科目在初一阶段打下了一定的基础，学生之间的差距相对较小。然而，到了初二，随着课程难度的增加和知识点的深入，学生之间的基础差异逐渐显现出来。一些学生在初一阶段没有打好基础，到了初二就会感到吃力，成绩自然下滑；而那些在初一阶段就努力学习、掌握扎实基础的学生，则能够轻松应对初二的挑战，成绩保持稳定甚至有所提升。
另一方面，科目三则包括一些拓展性和实践性较强的科目，如物理、化学和社会科学等。这些科目的学习需要学生具备较强的理解能力和应用能力。在初一阶段，这些科目的难度相对较低，学生之间的差距并不明显。但是到了初二，随着知识点的增多和难度的加大，学生之间的差距开始显现。一些学生可能因为理解能力较弱或者学习方法不当，导致成绩不理想；而那些具备较强理解能力和良好学习习惯的学生，则能够更好地掌握这些科目的知识点，成绩自然领先。
总的来说，初二是学生成绩差距开始显现的关键时期。在这个阶段，学生需要更加注重基础知识的积累和学习方法的改进，以便更好地应对未来的挑战。