甲鱼在历来被视为滋补佳品，因其含有丰富的蛋白质和不饱和脂肪酸，以及多种微量元素和抗癌物质。专家警告，并非所有人都适合食用甲鱼。对于久病体虚、阴虚胃寒、消化不良、食欲不振、痛风、甲亢和肝肾功能不全的人群，应当避免或谨慎食用甲鱼。
专家特别提醒，肝炎患者、肝硬化、肾衰竭和体弱多病的老年人，应当尽量减少或避免食用甲鱼。这些人群的肝、肾解毒能力较弱，如果摄入过多甲鱼，可能引发组胺物质过量进入血液，导致无法排除体外，严重时可能引发肝昏迷，甚至危及生命。
对于一般人来说，甲鱼对身体是有益的，特别是对于手术后的病人和癌症患者，其效果尤为明显。甲鱼的各个部位都蕴丰富的营养价值。目前，仿野生养殖的甲鱼因其腥味较淡，被视为较优质的品种。
值得注意的是，吃甲鱼必须现宰现吃。死甲鱼会分解产生有毒的组胺物质，引发食物中毒。宰杀后的甲鱼也不宜放置过久。
至于不能食用的甲鱼特征，主要包括：有明显的脓疮应当避免食用，或者将发炎处剪掉；肚子过分发白（白的像纸一样），这可能是白底板病的症状；脖子过分，地板有密集的小红点，这也是红脖子病和红底板病的症状，同样不能食用。
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