民办学校和独立院校虽然都属于高等教育机构，但在性质、资金来源、管理体制和办学历史等方面存在一些区别。
首先，民办学校通常是指由社会力量或个人投资兴办的学校，其资金主要来源于社会捐赠、学费收入等非政府财政拨款。而独立院校则是由公办高校与社会力量合作创办的，通常具有一定的政府支持，资金来源除了学费外，可能还包括政府补贴和合作高校的资源支持。
其次，在管理体制上，民办学校通常具有更高的自主性，学校内部管理和决策权更多地掌握在学校自身手中。而独立院校由于与公办高校存在合作关系，其管理可能受到一定程度的公办高校影响，决策权可能相对分散。
最后，从办学历史来看，独立院校往往依托于公办高校，具有一定的历史渊源和品牌优势。而民办学校的历史背景则更加多样化，可能由个人或社会团体发起创办，办学历史和传统各不相同。
总的来说，民办学校和独立院校在资金来源、管理体制和办学历史等方面存在一定的差异，这些差异也影响着学校的办学特色和发展方向。